تاثیر محصول ژن aiia بر روی بیان ژنهای بیماریزا و hrpباکتری pectobacterium carotovorum subsp. caratovorum
thesis
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی اصفهان - دانشکده کشاورزی
- author رامین اکبری
- adviser احد یامچی سیروس قبادی
- Number of pages: First 15 pages
- publication year 1391
abstract
بیش از چندین سال است که مشخص شده باکتریها قادر هستند جهت تنظیم هماهنگ بیان ژنها بر طبق تراکم جمعیتشان باهم ارتباط برقرار کنند که این سیستم معروف به حد نصاب حسگری (qs) میباشد. در واقع qs مکانیسم پیام دهنده سلول به سلول است که طبق آن باکتریها بیان ژنهای مشخصی را در پاسخ به تراکم جمعیتشان بوسیله تولید، آزاد کردن و شناسایی مولکولهای پیام رسان تنظیم میکنند. مولکولهای پیام رسان میتوانند توسط سلولها حس شوند بنابراین، این عمل به کل جمعیت اجازه میدهد هنگامی که تراکم به یک حد بحرانی رسید یک عمل مشترک را شروع کنند. باکتریهای گرم منفی ان-آسیل هوموسرین لاکتون (ahls) را بعنوان مولکول سیگنال بین سلولی تولید میکنند. p. carotovorum یکی از باکتریهایی است که از ahl به عنوان مولکول سیگنال در سیستم حد نصاب حسگری استفاده میکند. در این باکتری ahls بیان ژنهای بیماریزایی را کنترل میکند که شامل ژنهای کد کننده برای آنزیمهای برون سلولی، توکسین و تحرک میباشد. اختلال در qs که تحت عنوان qq یا ضد حدنصاب حسگری شناخته میشود از روشهای نوین و جایگزین در کنترل بیماریهای باکتریایی گیاهان میباشد که به دو طریق قابل انجام است 1) حفاظت گیاهان با استفاده از باکتریهای تجزیه کننده ahls و 2) بیان غیر متجانس آنزیمهای تجزیه کننده ahls در باکتریها یا بافتهای گیاهی. در این پژوهش تاثیر ژن aiia (لاکتوناز تجزیه کننده ahl) جدا شده از دو جدایه bacillus sp. a24 (جدایه خارجی) و dms133 bacillus sp. (جدایه ایرانی) در فعالیت بیماریزایی p. carotovorum به عنوان عامل بیماری پوسیدگی نرم سیبزمینی مورد ارزیابی قرار گرفت. در آزمون کنترل بیولوژیک هر دو باکتری تراریخت مورد استفاده فعالیت آنزیمی empcc را تحت تاثیر قرار دادند و به طور معنیدار از توسعه پوسیدگی نرم روی غدهها جلوگیری کردند. بیان ژن aiia در باکتری empcc باعث کاهش تولید ahl در باکتری و کاهش تجمع مولکولهای سیگنالی در محیط اطراف باکتری شد. به همین دلیل وقتی باکتری اندیکاتور cv026 در مجاورت باکتری تراریخت کشت داده شد هیچگونه رنگ بنفش در کلونی باکتری اندیکاتور مشاهده نشد. در آزمون بیماریزایی وقتی باکتریهای تراریخت و باکتری وحشی به ورقه های سیب زمینی تزریق شدند به دلیل اینکه پکتوباکتریوم از سیستم تنظیمی qs برای تولید فاکتورهای بیماریزایی استفاده میکند بیان ژن باعث سرکوب بیماریزایی پکتوباکتریوم روی غدههای سیب زمینی شده است. نتایج به دست آمده از واکنش real time pcr بیانگر میزان بالای بیان ژنهای nip, hrpc و hrpn در باکتریهای تراریخت در مقایسه با باکتری وحشی بودند. بررسی تفاوت در میزان بیان ژنهای آنزیمهای تجزیهکننده باکتریهای تراریخت نسبت به هم نشان دهنده تفاوت بسیار کم در میزان بیان ژنهای هر دو باکتری بوده و همانند نتایج بدست آمده از آزمایشات مورفولوژیکی نشان دهنده تفاوت بسیار کم ژنهای aiia جدا شده از جدایه داخلی و خارجی در قدرت کاهش بیماریزایی پکتوباکتریوم بودند. این پژوهش در شرایط آزمایشگاهی موفقیتآمیز بوده و در مواردی بطور کامل مانع از وقوع بیماریزایی پاتوژنهای مورد بررسی شد.
similar resources
Taxonomic relatedness between Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum, Pectobacterium carotovorum subsp. odoriferum and Pectobacterium carotovorum subsp. brasiliense subsp. nov.
AIMS Pectobacterium carotovorum is a heterogeneous species consisting of two named subspecies, P. carotovorum subsp. carotovorum and P. carotovorum subsp. odoriferum. A third subspecies, P. carotovorum subsp. brasiliense, was previously proposed. The study aimed to confirm the subspecies status and validate the proposed name of P. carotovorum subsp. brasiliense using a novel and standard microb...
full textComplete genome sequence of Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum bacteriophage My1.
Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum, a member of the Enterobacteriaceae family, is an important plant-pathogenic bacterium causing significant economic losses worldwide. P. carotovorum subsp. carotovorum bacteriophage My1 was isolated from a soil sample. Its genome was completely sequenced and analyzed for the development of an effective biological control agent. Sequence and morpholo...
full textGenetic Diversity of Pectobacterium carotovorum subsp. brasiliensis Isolated in Korea
The plant pathogenic bacterial genus Pectobacteirum consists of heterogeneous strains. The P. carotovorum species is a complex strain showing divergent characteristics, and a new subspecies named P. carotovorum subsp. brasiliensis has been identified recently. In this paper, we re-identified the P. carotovorum subsp. brasiliensis isolates from those classified under the subspecies carotovorum a...
full textSoft rot of calla is caused mainly by the bacterium Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum (Pcc)
We studied bacterial isolates 15M and 16M from calla lily tubers showing soft rot in commercial plantations in Poland. Colony morphology differed from that of known agents of bacterial soft rot of this plant. The use of Microgen Bacillus ID system allowed to identify both isolates as Paenibacillus polymyxa. This was confirmed by sequence analysis of 16S rRNA gene fragments. The isolates showed ...
full textIsolation and Genomic Characterization of the T4-Like Bacteriophage PM2 Infecting Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum
In order to control Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum, a novel virulent bacteriophage PM2 was isolated. Bacteriophage PM2 can infect 48% of P. carotovorum subsp. carotovorum and 78% of P. carotovorum subsp. brasilliensis but none of atrosepticum, betavasculorum, odoriferum and wasabiae isolates had been infected with PM2. PM2 phage belongs to the family Myoviridae, and contains a la...
full textCharacterization of genes required for the pathogenicity of Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum Pcc21 in Chinese cabbage
Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum is a well-known plant pathogen that causes severe soft rot disease in various crops, resulting in considerable economic loss. To identify pathogenicity-related factors, Chinese cabbage was inoculated with 5314 transposon mutants of P. carotovorum subsp. carotovorum Pcc21 derived using Tn5 transposon mutagenesis. A total of 35 reduced-virulence or av...
full textMy Resources
document type: thesis
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی اصفهان - دانشکده کشاورزی
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023